一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
皇帝被法术高人卫彦辖制，皇权名存实亡。在皇帝身边有一亲信名叫仙兔，是当年仙人用法术缔造出来的人，世世代代做皇帝的贴身护卫。除此之外，仙兔是这世上唯一知道世上仅有四人可以对抗卫彦，且这四人必须合力才能打败卫彦。 皇帝为铲除卫彦，命令仙兔去寻找四人。只要找到他们，就有望稳定江山，保护天下黎民。
商王殷寿（费翔 饰）勾结狐妖妲己（娜然 饰），暴虐无道，引发天谴。昆仑仙人姜子牙（黄渤 饰）携“封神榜”下山，寻找天下共主，以救苍生。西伯侯之子姬发（于适 饰）逐渐发现殷寿的本来面目，反出朝歌。各方势力暗流涌动，风云变幻端倪初显……